Protein foldning
Forløbet og modellen beskriver foldningen af et peptid (a-kæden af insulin) efter det er produceret som en kæde af aminosyrer. Foldningen sker efter regler i koden til computer modellen og disse regler er defineret uf fra aminosyrernes egenskaber såsom polaritet eller ladning.
Introduktion og beskrivelse af aktiviteten
Aktiviteten gør brug af en Netlogo model, hvor et peptid visualiseres som kugler af aminosyrer der er bundet sammen af pepetidbindinger der er grå. Eleverne arbejder med at ændre og skrive nye regler for hvordan aminosyrerne tiltrækkes af hinanden i peptidet og dermed foldes. Modellen illustrerer hvordan tilfældige bevægelser af aminosyrerne i et peptid har betydning for hvordan peptidet foldes. Og at der kan dannes mange forskelligt foldede pepetider, men at ikke alle er biologisk aktive.
Forløbet er designet til elever der har arbejdet med proteinsyntesen inden dette forløb.
Aktivitetens længde
Aktiviteten tager ca. 90 minutter i alt.
Materialer
Materialerne kan downloades her fra siden.
Aktivitetens sværhedsgrad
Den teoretiske sværhedsgrad svarer til Biotek A eller BioA.
Afprøvning
Forløbet og materialerne har været afprøvet i fem forskellige gymnasieklasser ed Bioteknologi A som studieretnigngsfag..
Forslag til forbedring
Forløbet kan med fordel bruges i forlængelse af undervisningen i proteinsyntesen.
Andet
Forløbet og modellen beskriver foldningen af et peptid (a-kæden af insulin) efter det er produceret som en kæde af aminosyrer. Foldningen sker efter regler i koden til computer modellen og disse regler er defineret uf fra aminosyrernes egenskaber såsom polaritet eller ladning.
Information om forløbet
Forfatter
- Line Have Musaeus
- CCTD Aarhus Universitet
Materialer
Teknologier
Årgange
Forskningsbaseret projekt
Undervisningsforløbet er udviklet af forskere tilknyttet CCTD. Forløbet kan være udarbejdet som en del af et større projekt, og materialet er derfor løbende blevet afprøvet med forskellige elever.
